Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms