Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.292e-8■■■■■ 31.6
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PRPF8Q6P2Q9 CRYM-AS1-203ENST00000561968 559 ntTSL 516.45■□□□□ 0.228e-16■■■■■ 31.6
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PRPF8Q6P2Q9 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.492e-8■■■■■ 31.6
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PRPF8Q6P2Q9 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.532e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 ACTR2-204ENST00000476840 587 ntTSL 411.75□□□□□ -0.538e-16■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 KPNB1-212ENST00000582126 653 ntTSL 511.71□□□□□ -0.542e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 SARAF-208ENST00000521265 1741 ntTSL 511.67□□□□□ -0.542e-8■■■■■ 31.6
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