Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms