Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD40Q6AI12 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD40Q6AI12 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD40Q6AI12 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD40Q6AI12 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD40Q6AI12 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD40Q6AI12 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD40Q6AI12 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD40Q6AI12 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD40Q6AI12 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD40Q6AI12 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD40Q6AI12 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms