Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USPL1Q5W0Q7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms