Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms