Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms