Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GKAP1Q5VSY0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms