Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3CQ5T2N8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms