Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAN3Q58A45 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms