Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms