Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms