Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms