Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms