Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms