Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM16Q2WEN9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms