Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms