Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ECM1Q16610 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms