Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms