Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms