Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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