Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDGFRLQ15198 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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