Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
EEA1Q15075 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms