Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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NCAPHQ15003 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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NCAPHQ15003 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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NCAPHQ15003 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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