Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.58e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 CCDC12-209ENST00000604164 399 ntTSL 311.91□□□□□ -0.55e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 AGRN-203ENST00000461111 3385 ntTSL 1 (best)11.79□□□□□ -0.522e-12■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-227ENST00000560970 1039 ntTSL 1 (best)11.68□□□□□ -0.545e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SCARB1-204ENST00000535005 1845 ntTSL 1 (best)11.6□□□□□ -0.553e-10■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 CRTAP-201ENST00000320954 6630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.558e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TM9SF4-201ENST00000217315 4032 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.561e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-205ENST00000361830 4318 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.598e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SLC16A1-202ENST00000429288 865 ntTSL 311.28□□□□□ -0.61e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SLC16A1-205ENST00000478835 452 ntTSL 1 (best)11.23□□□□□ -0.611e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 BRD2-208ENST00000464592 1590 ntTSL 510.81□□□□□ -0.687e-24■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 BCOR-212ENST00000615339 2618 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.688e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SLC16A1-203ENST00000443580 1099 ntTSL 310.72□□□□□ -0.691e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-212ENST00000558347 1525 ntTSL 510.6□□□□□ -0.715e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 HSPD1-209ENST00000452200 888 ntTSL 510.57□□□□□ -0.721e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SRRM1-221ENST00000593639 563 ntTSL 510.48□□□□□ -0.733e-10■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-214ENST00000468590 691 ntTSL 510.33□□□□□ -0.768e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-218ENST00000493301 597 ntTSL 310.33□□□□□ -0.768e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SAP30BP-203ENST00000542343 1011 ntTSL 210.33□□□□□ -0.768e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 EFTUD2-224ENST00000592701 562 ntTSL 410.19□□□□□ -0.788e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 GNAS-246ENST00000487981 581 ntTSL 510.16□□□□□ -0.789e-15■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-210ENST00000558264 2687 ntTSL 210.01□□□□□ -0.815e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 HSPD1-211ENST00000476746 853 ntTSL 29.97□□□□□ -0.811e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 AUP1-203ENST00000462297 457 ntTSL 39.9□□□□□ -0.828e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 FAM162A-203ENST00000477892 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.838e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-221ENST00000559831 573 ntTSL 59.78□□□□□ -0.845e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-204ENST00000359617 4273 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.868e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 QARS-228ENST00000634432 582 ntTSL 39.67□□□□□ -0.868e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-206ENST00000371132 4552 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.888e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SRPK2-209ENST00000476117 703 ntTSL 29.56□□□□□ -0.888e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 POM121-204ENST00000446813 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.898e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-203ENST00000358029 4329 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.98e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ZBTB40-204ENST00000404138 8992 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.911e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MPP1-203ENST00000393529 794 ntTSL 59.22□□□□□ -0.938e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 HSPD1-208ENST00000440114 619 ntTSL 59.17□□□□□ -0.941e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 HSPD1-210ENST00000461097 714 ntTSL 28.96□□□□□ -0.981e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ZBTB40-202ENST00000375647 8685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.981e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ZBTB40-201ENST00000374651 8368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.981e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 EFTUD2-222ENST00000592408 561 ntTSL 48.67□□□□□ -1.028e-6■□□□□ 8.1
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PUM1Q14671 QARS-250ENST00000637281 1327 ntTSL 57.96□□□□□ -1.148e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-231ENST00000561395 673 ntTSL 57.91□□□□□ -1.145e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ARHGEF12-206ENST00000528225 2647 ntTSL 57.9□□□□□ -1.155e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MPP1-217ENST00000493871 585 ntTSL 27.8□□□□□ -1.168e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 BCOR-211ENST00000490976 3480 ntTSL 27.79□□□□□ -1.168e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 C6orf106-201ENST00000374021 916 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.171e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.25e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-212ENST00000464640 812 ntTSL 27.53□□□□□ -1.28e-6■□□□□ 8.1
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PUM1Q14671 TNIK-215ENST00000496492 2736 ntTSL 1 (best)7.21□□□□□ -1.261e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.38e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 UBN2-203ENST00000486663 589 ntTSL 46.76□□□□□ -1.332e-12■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.371e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 FBL-202ENST00000593503 628 ntTSL 36.4□□□□□ -1.388e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.431e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 HSPD1-204ENST00000426480 529 ntTSL 45.78□□□□□ -1.481e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.495e-9■□□□□ 8.1
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PUM1Q14671 ARHGEF12-212ENST00000532823 1099 ntTSL 55.06□□□□□ -1.65e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ARHGEF12-208ENST00000529970 3786 ntTSL 24.8□□□□□ -1.645e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 HSPD1-206ENST00000430176 754 ntTSL 54.8□□□□□ -1.641e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.675e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 EIF4G3-209ENST00000463775 711 ntTSL 34.43□□□□□ -1.78e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TAF1D-208ENST00000527690 335 ntTSL 34.3□□□□□ -1.728e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 YWHAH-203ENST00000420430 502 ntTSL 24.28□□□□□ -1.721e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 GON4L-213ENST00000488251 779 ntTSL 33.9□□□□□ -1.791e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SAP30BP-216ENST00000581385 253 ntTSL 21.27□□□□□ -2.218e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.915e-10■□□□□ 8
PUM1Q14671 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.725e-10■□□□□ 8
PUM1Q14671 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.035e-10■□□□□ 8
PUM1Q14671 SRP14-202ENST00000558243 770 ntTSL 514.88□□□□□ -0.035e-10■□□□□ 8
PUM1Q14671 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.115e-10■□□□□ 8
PUM1Q14671 SRP14-203ENST00000558527 791 ntTSL 214.1□□□□□ -0.155e-10■□□□□ 8
PUM1Q14671 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.165e-10■□□□□ 8
PUM1Q14671 SRP14-205ENST00000559081 578 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.535e-10■□□□□ 8
PUM1Q14671 SRP14-207ENST00000559475 463 ntTSL 28.53□□□□□ -1.045e-10■□□□□ 8
PUM1Q14671 SRP14-206ENST00000559439 743 ntTSL 36.65□□□□□ -1.345e-10■□□□□ 8
PUM1Q14671 RBBP7-212ENST00000493145 212 ntTSL 315.48■□□□□ 0.073e-22■□□□□ 8
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