Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RASGRF1Q13972 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGRF1Q13972 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms