Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCINQ13939 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCINQ13939 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCINQ13939 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCINQ13939 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCINQ13939 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCINQ13939 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCINQ13939 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCINQ13939 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCINQ13939 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCINQ13939 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCINQ13939 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCINQ13939 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCINQ13939 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCINQ13939 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCINQ13939 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCINQ13939 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCINQ13939 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCINQ13939 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCINQ13939 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCINQ13939 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCINQ13939 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCINQ13939 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCINQ13939 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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