Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMC2Q13753 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LAMC2Q13753 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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