Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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