Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms