Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCGB2A2Q13296 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms