Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CALCOCO2Q13137 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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