Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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NR1H3Q13133 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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NR1H3Q13133 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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NR1H3Q13133 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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