Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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TRAF2Q12933 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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TRAF2Q12933 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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