Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHD3Q12873 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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