Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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TWF1Q12792 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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TWF1Q12792 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWF1Q12792 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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