Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms