Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4BQ07343 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PDE4BQ07343 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4BQ07343 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4BQ07343 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4BQ07343 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4BQ07343 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4BQ07343 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4BQ07343 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4BQ07343 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE4BQ07343 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE4BQ07343 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms