Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms