Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC090515.5-201ENST00000560378 526 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms