Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms