Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms