Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FOXO4P98177 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO4P98177 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms