Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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FAM3AP98173 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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FAM3AP98173 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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FAM3AP98173 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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FAM3AP98173 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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FAM3AP98173 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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FAM3AP98173 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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FAM3AP98173 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3AP98173 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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