Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIM1P81133 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIM1P81133 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIM1P81133 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms