Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms