Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIK1P57059 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SIK1P57059 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIK1P57059 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIK1P57059 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIK1P57059 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIK1P57059 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIK1P57059 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIK1P57059 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIK1P57059 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIK1P57059 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SIK1P57059 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIK1P57059 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIK1P57059 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIK1P57059 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIK1P57059 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIK1P57059 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIK1P57059 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIK1P57059 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIK1P57059 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIK1P57059 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIK1P57059 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIK1P57059 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIK1P57059 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SIK1P57059 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIK1P57059 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIK1P57059 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIK1P57059 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIK1P57059 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIK1P57059 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIK1P57059 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIK1P57059 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIK1P57059 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIK1P57059 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIK1P57059 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIK1P57059 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIK1P57059 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIK1P57059 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIK1P57059 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIK1P57059 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIK1P57059 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms