Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME5P56597 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME5P56597 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME5P56597 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME5P56597 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME5P56597 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME5P56597 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME5P56597 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME5P56597 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME5P56597 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME5P56597 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME5P56597 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME5P56597 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME5P56597 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME5P56597 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME5P56597 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME5P56597 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME5P56597 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME5P56597 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME5P56597 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME5P56597 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME5P56597 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME5P56597 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME5P56597 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME5P56597 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NME5P56597 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME5P56597 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME5P56597 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME5P56597 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME5P56597 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME5P56597 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME5P56597 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME5P56597 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME5P56597 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME5P56597 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME5P56597 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME5P56597 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME5P56597 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME5P56597 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms