Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP6P55212 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP6P55212 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP6P55212 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP6P55212 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP6P55212 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms