Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
ERFP50548 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ERFP50548 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ERFP50548 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERFP50548 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERFP50548 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms